2020年7月 – medium

On the advantages of exploiting memory in Markov state models for biomolecular dynamics, S Cao, A Montoya-Castillo, W Wang, TE Markland… – The Journal of Chemical …, 2020

マルコフ状態モデル（MSM）

分子動力学（MD）シミュレーションにおける運動過程(タンパク質ダイナミクス)＝離散時間間隔（ラグタイム）でのコンフォメーション状態間の一連のマルコフ遷移からなる

今回提案のqMSM

quasi-Markov State Models (qMSMs)準マルコフ状態モデル

理想的なシュミレーション；状態間の遷移が真のマルコフになるように、十分に長い遅延時間でマスター方程式が構築
実際には；遷移の頻度を推定する際のMDシミュレーションの長さが比較的短いため、ラグタイムは制約されている

MSMで必要なモデルよりも5〜10倍短いMDシミュレーションを使用したことを示せた

単純な速度論モデル
アラニンジペプチド
WWドメイン

J. Chem. Phys. 153, 014105 (2020)

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Immunocytochemical Localization of Olfactory-signaling Molecules in Human and Rat Spermatozoa, Y Makeyeva, C Nicol, WL Ledger, DK Ryugo – Journal of Histochemistry & …, 2020

https://journals.sagepub.com/doi/10.1369/0022155420939833

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AirConnectをCentOS_8上に構築してみる

気分転換(？)に、Google homeにAirplayできるように転送してくれるスクリプトがあったので、CentOS 8 上で実行してみた。

Google HomeでAirPlayが使えればHomePodがいらないんじゃないか説
 AirConnect

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Human Olfaction without Apparent Olfactory Bulbs, E Furman-Haran, T Dhollander, N Sobel – Neuron, 2020

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0896627319308542

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Croy, I., Buschhüter, D., Seo, H. et al. Individual significance of olfaction: development of a questionnaire. Eur Arch Otorhinolaryngol 267, 67 (2010). https://doi.org/10.1007/s00405-009-1054-0

Croy, Ilona & Buschhüter, Dorothee & Seo, Han-Seok & Negoias, Simona & Hummel, Thomas. (2009). Individual significance of olfaction: Development of a questionnaire. European archives of oto-rhino-laryngology : official journal of the European Federation of Oto-Rhino-Laryngological Societies (EUFOS) : affiliated with the German Society for Oto-Rhino-Laryngology - Head and Neck Surgery. 267. 67-71. 10.1007/s00405-009-1054-0.

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Contribution of odorant binding proteins to olfactory detection of (Z)-11-hexadecenal in Helicoverpa armigera, H Guo, PP Guo, YL Sun, LQ Huang, CZ Wang – bioRxiv, 2020

Cite

Contribution of odorant binding proteins to olfactory detection of (Z)-11-hexadecenal in Helicoverpa armigera
Hao Guo, Ping-Ping Guo, Ya-Lan Sun, Ling-Qiao Huang, Chen-Zhu Wang
bioRxiv 2020.06.10.145235; doi: https://doi.org/10.1101/2020.06.10.145235

This article is a preprint and has not been certified by peer review.

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