Memo
生態学的種分化中に発生する分子進化プロセスへの関心
- 昆虫のOR, GRなどの化学刺激受容体の進化と餌の嗜好性の関連性が多く調べられている。今回もドラフトゲノムの作成と合わせて「食性種の宿主植物の特殊化への洞察を提供するために、化学感作、植物二次化学の解毒、および植物細胞壁分解に関与する主要な遺伝子ファミリー」が特定されている。一般に、化学感覚遺伝子の含有量と宿主の特異性が、植物食性カブトムシにおいて相関するはずであるという仮説を（今回のドラフトゲノムでも）支持している[52]。
- 報告されているのは、化学物質の検出に関与する少なくとも5つの遺伝子ファミリーがあり、3つの受容体ファミリー、嗅覚受容体（OR）、味覚受容体（GR）およびイオンチャネル型受容体（IR）、および2つのタンパク質結合ファミリーであるにおい結合タンパク質（OBP）および化学感覚タンパク質（CSP）。
→OBPについても報告されるようになってきた。OBPの役割についての決定的な論拠はないので興味がもたれる。
flea beetle Altica viridicyanea (Coleoptera: Chrysomelidae)
- ハムシ（葉虫、金花虫、英語：Leaf beetle）は、甲虫目ハムシ科 Chrysomelidaeの昆虫の総称。現在日本に約780種が知られる。6mm前後のものが多く、おおむね草食性である。
- Altica Geoffroy, 1762 ；ハムシ科 > ノミハムシ亜科 > カミナリハムシ属
Abstract(自動翻訳)
バックグラウンド ; カミナリハムシ（甲虫目：ハムシ科）は、宿主植物への特化、生殖隔離、および生態学的種分化に関する研究においてモデルシステムとして使用されている、非常に多様で分類学的にノミハムシ属です。この重要なグループのさらなる進化的研究のために、ここでは、これまでに報告されたAltica viridicyanea、最初のAlticinaeゲノムおよび4番目のハムシ科ゲノムの高品質ドラフトゲノムを示します。
結果 ; ゲノムは864.8 Mbで、N50サイズが557 kbの4,490の配列で構成され、完全な98.6％と0.4％の部分的な昆虫のベンチマークユニバーサルなシングルコピーオーソログが得られました。反復配列はアセンブリの62.9％を占め、合計17,730のタンパク質コーディング遺伝子モデルと2,462非コーディングRNAモデルが得られました。この一食性種の宿主植物の特殊化への洞察を提供するために、化学感作、植物二次化学の解毒、および植物細胞壁分解に関与する主要な遺伝子ファミリーを調べました。
この研究で組み立てられた高品質のゲノムは、宿主植物の適応と機能的に関連する遺伝子に関するさらなる研究のための重要なリソースを提供します。さらに、この研究はまた、密接に関連するカミナリハムシ種間の比較ゲノミクス研究への道を開き、生態学的種分化中に発生する分子進化プロセスへの洞察を提供する可能性があります。